In maart trok de organisatie Folding@Home aardig wat bekijks, doordat zijn coronaproject meer rekenkracht had dan 's werelds krachtigste supercomputer. Nu heeft het bekendgemaakt dat het Nvidia's cuda-technologie gaat ondersteunen om beter gebruik te kunnen maken van de beschikbare hardware.
Folding@Home heeft zijn software gebaseerd op de OpenMM-toolkit die specifiek bedoeld is voor moleculaire simulaties, zoals voor Covid Moonshot. Nvidia's cuda-software weet voor prestatieverbeteringen van 15 tot 30% te zorgen in de meeste gpgpu-projecten. In Covid Moonshot verbetert het de prestaties met 50 tot 100%, afhankelijk van de gpu.
Uiteraard is voor het gebruik van cuda een Nvidia-videokaart nodig. Er is ondersteuning vanaf de Kepler-generatie. De organisatie meldt dat cuda automatisch geactiveerd moet zijn vanaf Folding@Home's core22 0.0.13. Mocht dit niet het geval zijn, dan wordt aangeraden om hulp te zoeken via het forum op de site. Met het covid-19-project wordt onderzocht welke eiwitten kunnen functioneren als antilichaam voor de receptoren op het virus, om zo een goed schaalbaar medicijn te maken. Uiteraard geldt de update voor meer geneeskundige problemen, zoals voor het Alzheimerproject van de organisatie.
De dermogorgon op het celmembraan van covid-19. Afbeelding met dank aan SciStyle.
Bron: Folding@Home